Ο Ποταμός Δούναβης, ο δεύτερος μακρύτερος υδατόδρομος της Ευρώπης, υποστηρίζει εξαιρετική βιοποικιλότητα καθ' όλη την 2.850 χλμ διαδρομή του μέσω δέκα χωρών. Από την πηγή του στη Μελάνια Δάσος της Γερμανίας μέχρι τη δέλτα του στη Μαύρη Θάλασσα, ο ποταμός διατηρεί πλούσια οικοσυστήματα που φιλοξενούν εκατοντάδες είδη.
Οι πληθυσμοί ψαριών του Δούναβη είναι εντυπωσιακά, συμπεριλαμβανομένων τριών ειδών στουρίων—της βελούγας (το μεγαλύτερο γλυκόνερο ψάρι του κόσμου), του ρωσικού στουρίου, και του αστέρου στουρίου. Άλλα αξιοσημείωτα εγχώρια είδη περιλαμβάνουν καρπά, λούτσες, γάτες ψαριών, και τη μετανάστευση ευρωπαϊκού χελιού, που ταξιδεύει χιλιάδες χιλιόμετρα ανάμεσα στον Δούναβη και τη Θάλασσα Σαργάσσου για να αναπαράγει.
Ο ποταμός και τα υγρά του τοπούλια λυτρώνουν ποικίλα πουλιά. Μεγαλειώδεις λευκокέφαλοι αετοί και γυπαστανοί κυνηγούν κατά μήκος των υδατοδρόμων, ενώ χρωματιστά αλκυόνες πετάγουν πάνω από την επιφάνεια. Μεγάλοι κορακοί και γκρι τσιχλώνες κυνηγούν στα ρηχά, και η Δέλτα του Δούναβη μόνη της φιλοξενεί πάνω από 300 είδη πουλιών, κάνοντάς την Μνημείο Παγκόσμιας Κληρονομιάς της UNESCO και παράδεισο παρατηρητών πουλιών.
Οι ευρωπαϊκές κάστωρες, που κάποτε ήταν σχεδόν εξαφανισμένες, έχουν κάνει εντυπωσιακή επιστροφή κατά μήκος του Δούναβη. Οι βίδρες κυνηγούν στα υπολείμματα του ποταμού, ενώ οι ονδατρές κατοικούν τις όχθες. Μεγαλύτερα θηλαστικά περιλαμβάνουν άγρια χοίρα και ελαφιά ελαφιά, που επισκέπτονται τα δάση και τις πλαισιματικές πλαισίματα για νερό και βότανη.
Ευρωπαϊκές χελώνες λιμνών ηλιοβασιρίζουν σε κλάδους, ενώ χλωρόφιδια και ζαρκιά φίδια κυνηγούν στα ρηχά. Το φιδίο ευρωπαϊκό vípera επίσης στέκεται στη περιοχή. Τα αμφίβια περιλαμβάνουν κοινές βάτραχες, πράσινες φρίνες, εντυπωσιακές σαλαμάνδρες φωτιάς, και αλπινές τριτόνες—όλα εξαρτώμενα από τα υγρά του ποταμού για αναπαραγωγή.
Ο Δούναβης τρεμίζει από έντομα: λιβελλούλες και αγρίδες παρελθούσες το λιμνικό ακρογιάλι, πεταλούδες και νυχτερίδες επισκέπτονται λουλούδια ακτογραφικά, ενώ κάνθαροι, αράχνες, σαλιγκάρια, και γλυκύ μύδια ολοκληρώνουν το πολύπλοκο τροφικό δίκτυο που διατηρεί αυτό το ζωηρό οικοσύστημα.