Το όνομα προέρχεται από το Sargassum, ένα γένος καφέ θαλασσιάς. Πρώιμες ισπανικές και πορτογαλικές ναύτες το ονόμασαν Mar de los Sargazos («Θάλασσα των Σαργάσσων») διότι πυκνά χαλιά της πλωτικής άλγας (και τα καρποειδή της αναπαραγωγικά όργανα) χρωμάτιζαν την επιφάνεια. Ο όρος συντομεύτηκε αργότερα σε «Θάλασσα των Σαργάσσων».
