Η Κολομβία είναι χώρα πλούσια σε φυσικά θησαυρούς. Το μεγαλύτερο μέρος της επικαλύπτεται από τροπικά δάση, όπου ζουν πολλοί ζώοι και φυτά που βρίσκονται αποκλειστικά εδώ. Η χώρα ξεχωρίζει για την εξαιρετική βιοποικιλότητα της, ειδικά στη χλωρίδα, η οποία presenter την υψηλότερη ποσότητα ειδών ανά μονάδα επιφάνειας σε όλο τον πλανήτη, σύμφωνα με το Living National Treasures.
Μεταξύ των αστκοτόκων που ζουν μόνο στη Κολομβία βρίσκονται πολλοί τύποι νυχτερίδων, όπως η κολομβιανή βραχυοινή νυχτερίδα· μουρμούρια, όπως το μικρό ουτάκι του Μεδεγίν· σκίουρα, όπως η νάνα σκίουρα του Σαντάντερ· και ποντίκια, όπως το λευκόποδο ποντίκι του Χάντλεϊ. Η Κολομβία έχει επίσης μεγάλο αριθμό ντόπιων γκουφάδων, π.χ. η γκουφάδα του Θάελερ, δορκανθολούδες όπως η καφέ τριχοειδής νάνα δορκανθολούδα, και ποντίκια όπως το ακανθοειδές ποντίκι του Μίνκα. Τα κολομβιανά δάση είναι πυκνά κατοικημένα από πιθήκους, μεταξύ των οποίων οι κολομβιανές μαύρες τίτι και ο νυκτικός πιθήκος του Χέρσκοβιτς, γνωστός και ως γκρικοίλιος πιθήκος.
Το πτηνό βασίλειο έχει επίσης πολλοί εκπρόσωποι στη Κολομβία. Σύμφωνα με το Living National Treasures, η πιο πρόσφατη ανακάλυψη πουλιού στη Κολομβία συνέβη το 2007, όταν επιβεβαιώθηκε η ύπαρξη του Αντιοκιάν φίνκι. Εκτός από αυτά, η Κολοombia φιλοξενεί πολλούς παπαγάλλους, όπως ο ινδικόπτερος παπαγάλος και μικρότεροι παπαγαλάκια, όπως το παπαγαλάκι της Σάντα Μάρτα. Πολλοί κολομβιανοί existent καλορτίζ, όπως ο σαφειρίνο κολορτίζ. Ταναγκαρίδες, σπίνοι και φυλλοσκόποι είναι επίσης συνηθισμένα είδη στη Κολομβία.
Λόγω γεωργίας και βιομηχανίας, πολλά ντόπια δέντρα της Κολομβίας απειλούνται με εξαφάνιση. Μερικά από τα είδη δέντρων που αναπτύσσονται σε όλη τη Κολομβία είναι η βραζιλιάνικη καρύδα, το αμαζόνιο σταφύλι, η πλατονία και η πεκέα καρύδα. Υπάρχουν επίσης δέντρα που παράγουν βρώσιμα φρούτα στα κολομβιανά δάση. Πολύ συνηθισμένα φρούτα στη Κολομβία περιλαμβάνουν, ενδεικτικά, καρύδες ανγκαρού, φρούτο της πάσιος και αγριοκαρπός.
Η Κολομβία είναι η χώρα με τον μεγαλύτερο αριθμό ορχιδέων στον κόσμο. Πάνω από εκατό δείγματα διαφορετικών ορχιδέων αναπτύσσονται άγρια στη Κολοmbia, το πλείστον από τα οποία κρυμμένο βαθιά στα δάση βροχής. Αפילו το εθνικό λουλούδι της Κολομβίας είναι είδος ορχιδέας, η Cattleya trianae, γνωστή και ως ορχιδέα των Χριστουγέννων. Επιλέχθηκε ως επίσημο λουλούδι λόγω του χρώματος των πετάλων της, τα οποία ταιριάζουν με αυτά της κολομβιανής σημαίας.