Επειδή οι Φιλιππίνες αποτελούνται από περισσότερες από 7.000 νήσους, ο πιο αποτελεσματικός τρόπος ταξιδεύματος στη νοτιοανατολική ασιατική χώρα είναι το αεροπλάνο. Ευτυχώς, η 50ετής περίοδος ως αμερικανική κολωνία άφησε στη χώρα εξαιρετική αεροπορική υποδομή.
Οι Φιλιππίνες διαθέτουν δέκα διεθνή αεροδρόμια. Το Διεθνές Αεροδρόμιο Ninoy Aquino στη Μανίλα είναι το μεγαλύτερο και δέχεται πτήσεις από όλο τον κόσμο. Τα αεροδρόμια Mactan International και Iloilo International συνδέονται κυρίως με πόλεις της νοτιοανατολικής Ασίας. Πάνω από 200 εσωτερικά αεροδρόμια ενώνουν τη χώρα.
Η Philippine Airlines είναι η εθνική αεροπορική εταιρεία, αλλά μικρότερες εταιρείες ανταγωνίζονται για τις εσωτερικές και ασιατικές διαδρομές. Το 2010 αυτές περιλάμβαναν τη Cebu Pacific, Asian Spirit, PAL Express, South East Airlines, Air Philippines, Pacific Pearl Airways και Interisland Airlines.
Οι πτήσεις προς ή μέσα στις Φιλιππίνες απαιτούν πληρωμή φόρου αναχώρησης. Επιπλέον, τα εισιτήρια που αγοράζονται στο εξωτερικό απαιτούν πρόσθετη πληρωμή φόρου ταξιδιού πριν την αναχώρηση από τις Φιλιππίνες.