Όταν ένα πλοίο μπαίνει σε μια κλειδαριά, οι πύλες πίσω από αυτό κλείνουν και το νερό στην κλειδαριά ανυψώνεται ή χαμηλώνει ώστε να ταιριάζει με τη στάθμη του νερού του επόμενου τμήματος του καναλιού. Στη συνέχεια, το πλοίο περνά μέσα από τις ανοιχτές πύλες και στο επόμενο τμήμα του καναλιού.
Το κανάλι του Παναμά έχει συνολικά έξι κλειδαριές, τρεις σε κάθε πλευρά. Κάθε κλειδαριά έχει μήκος περίπου 1.000 πόδια, πλάτος 110 πόδια και βάθος 75 πόδια. Οι κλειδαριές μπορούν να φιλοξενήσουν πλοία μήκους έως 1.200 πόδια και πλάτους 150 ποδιών.
Οι κλειδαριές του καναλιού του Παναμά αποτελούν σημαντικό μέρος της λειτουργίας του καναλιού και επιτρέπουν στα πλοία να περνούν μέσα από το κανάλι με ασφάλεια και αποτελεσματικότητα.