Ο τομέας μεταφορών είναι μεγάλος χρήστης ενέργειας, και η επιλογή καυσίμου του έχει μεγάλη επίδραση στο περιβάλλον. Καταναλώνει σχεδόν το 70 ποσοστό του πετρελαίου που εισάγεται στις Η.Π.Α. και είναι υπεύθυνος για περισσότερο από το μισό της ατμοσφαιρικής ρύπανσης της χώρας. Εναλλακτικές λύσεις στη βενζίνη μπορούν να είναι καθαρότερες και μερικές φορές πιο κόστ-εφфектив, αν και μπορούν επίσης να έχουν μειονεκτήματα.
Ο τομέας μεταφορών μπορεί να χρησιμοποιήσει βιοαέριο όπως εθανόλη, μεθανόλη και βιοντίζελ. Οι παραγωγοί φτιάχνουν αυτά τα καύσιμα μέσω ζύμωσης φυτών τροφίμων --- σάκχαρο, καλαμπόκι, δημητριακά και άλλα --- ή από ξύλινους απορρίμματα. Η χρήση αυτών των καυσίμων παρουσιάζει έναν αριθμό ανησυχιών, ωστόσο. Η παραγωγή αυτών των καυσίμων είναι ενεργειακά εντάσιη, το οποίο είναι ένα ζήτημα. Επίσης, η καλλιέργεια των φυτών που απαιτούνται για την παραγωγή αυτών των καυσίμων απαιτεί γη που οι άνθρωποι θα μπορούσαν αλλιώς να χρησιμοποιήσουν για να καλλιεργήσουν φυτά για φαγητό. Τέλος, ένα περιορισμένο ποσό καυσίμου μπορεί να παραχθεί με αυτόν τον τρόπο, το οποίο δεν θα ικανοποιήσει τις ανάγκες του τομέα μεταφορών.
Το υδρογόνο είναι ένα αποδοτικό εναλλακτικό καύσιμο που εκπέμπει σχεδόν κανένα ρύπο. Οι производی παράγουν υδρογόνο είτε από νερό είτε από υδατάνθρακες και το μετατρέπουν σε υγρή μορφή, επιτρέποντας σε άλλους να το χρησιμοποιήσουν για να παράγουν ηλεκτρισμό για να τροφοδοτήσουν οχήματα. Οι χρήστες υδρογόνου μπορεί να αντιμετωπίσουν δυσκολίες καθώς η αποθήκευση καυσίμου απαιτεί χαμηλές θερμοκρασίες, υπό υψηλή πίεση, καθώς είναι αέρας στις κανονικές θερμοκρασίες και πιέσεις. Η παραγωγή υδρογόνου και η μετατροπή του σε ηλεκτρισμό είναι επίσης ενεργειακά εντάσιη διαδικασία.
Ο ηλεκτρισμός είναι μια αποδοτική πηγή εναλλακτικού καυσίμου. Είναι πιο αποδοτικός από τη χρήση υδρογόνου εφόσον οι χρήστες πρέπει να μετατρέψουν το τελευταίο σε ηλεκτρισμό. Η χρήση ηλεκτρισμού ως καύσιμου μπορεί να είναι ιδιαίτερα ωφέλιμη για το περιβάλλον, καθώς δεν εκπέμπει τους ρύπους που παράγουν οι κινητήρες βενζίνης. Ένα ζήτημα με τη χρήση ηλεκτρισμού είναι η δυσκολία που παρουσιάζει στην αποθήκευση αρκετής ενέργειας για να επιτευχθούν ταχύτητες και εύρος οδήγησης συγκρίσιμα με αυτά των οχημάτων με εσωτερικούς κινητήρες καύσης.
Το φυσικό αέριο παρουσιάζεται φυσικά ως μίγμα αερίων σε τρώτσες περατώσεις πετρώματα. Οι производί το κάνουν καύσιμο σε υγρή και συμπιεσμένη μορφή και πρέπει να το εξαγάγουν, να το καθαρίσουν και είτε να το συμπιέσουν για αποθήκευση και μεταφορά είτε να το μετατρέψουν σε υγρή μορφή. Η μετατροπή ενός οχήματος να τρέχει σε φυσικό αέριο μπορεί να είναι κόστ-εφфектив κατά τη διάρκεια της ζωής του. Η χρήση φυσικού αερίου παράγει λιγότερους τοξικούς ρύπους και ρύπους θερινοκηπίου από βενζίνη ή diesel. Η μεταφορά και διαχείριση συμπιεσμένου φυσικού αερίου είναι επίσης ευκολότερη, μειώνοντας διαρροές και άλλα ατυχήματα.
