Τα κοραλλιογενή ρίφ είναι μοναδικά οικοσυστήματα που δημιουργούνται από κοραλλιογενείς, ζωντανούς οργανισμούς που εκκρίνουν ένα σκληρό σκελετό ασβεστίου που δημιουργεί τη βάση του ρίφ. Τα κοραλλιογενή ρίφ είναι σπίτι ευρείας ποικιλίας οργανισμών που χρησιμοποιούν τους κοραλλιογενείς ως καταφύγιο και πηγή τροφής. Τα κοραλλιογενή ρίφ μπορούν να βρεθούν στη Φλόριδα, Αυστραλία, τα Καραϊβικά, Ινδία και την Ερυθρά Θάλασσα.
Οι κοραλλιογενείς παρέχουν τη ραχοκοκαλιά των κοραλλιογενών ρίφ. Αν και οι κοραλλιογενείς συχνά αναφέρονται ως οργανισμοί δικού τους, είναι, στην πραγματικότητα, αποτελούμενοι από μικροσκοπικά ζώα που ονομάζονται polyps. Τα σκληρά κοραλλιογενή αποτελούνται από polyps με εξαπτέρυγα ή πολλαπλάσια εξαπτέρυγων. Τα μαλακά κοραλλιογενή έχουν polyps με οκτώ πτερύγια.
Φάλαινες, δελφίνες, χαρχαριές και φωκίες είναι μεταξύ των πιο μαγευτικών ειδών που μπορούν να βρεθούν στα κοραλλιογενή ρίφ. Περίπου 30 είδη φαλαινών, δελφίνων και φωκιών ζουν ή επισκέπτονται μόνο το Great Barrier Reef. Οι dwarf minke φάλαινες και οι baleen φάλαινες ελκύονται στα ρίφ από τα τεράστια ποσά μικροσκοπικών πλανκτόν και krill, τα οποία αποτελούν τη κύρια τους δίαιτα. Δελφίνες, χαρχαριές και φωκίες τρέφονται με μεγαλύτερα ψάρια, που βρίσκονται σε αφθονία στα κοραλλιογενή ρίφ, ιδίως σε swallow νερά σε estuaries ή ποταμούς mouths.
Χιλιάδες είδη ψαριών ζουν στα κοραλλιογενή ρίφ. Ποικίλλουν σε μέγεθος, χρώμα, longevity και patterns αναπαραγωγής. Για παράδειγμα, η anemone, το ταχύτερο ψάρι που ζει στα κοραλλιογενή ρίφ, μπορεί να κολυμπήσει εννιά και μισά body lengths ανά δευτερόλεπτο, σε σύγκριση με περίπου δύο body lengths ανά δευτερόλεπτο του ταχύτερου Ολυμπιονίκη κολυμπητή. Στην άλλη ακμή είναι το ιππόκαμπο, το οποίο, παρά το όνομά του, δεν είναι πολύ γρήγορο και χρειάζεται περίπου δύο και μισή ημέρα για να ταξιδέψει ένα χιλιόμετρο, ή περίπου 0,62 μίλια.
Τα είδη θαλασσινών χελώνων που μπορούν να βρεθούν στα κοραλλιογενή ρίφ περιλαμβάνουν Green, Leatherback, Loggerhead, Flatback, Hawksbill και Olive Ridley χελώνες. Οι θαλασσινές χελώνες κλαδεύουν αυγά στην άμμο. Η θερμοκρασία της άμμου καθορίζει το φύλο των χελώνων, με ψυχρότερη άμμο να παράγει αρσενικά χελώνες και ζεστότερη άμμο να οδηγεί σε θηλυκά χελώνες. Οι θαλασσινές χελώνες μπορούν να ζήσουν έως 100 χρόνια. Δεκατέσσερα είδη θαλασσινών φιδιών βρίσκονται στα κοραλλιογενή ρίφ. Τα θαλασσινά φίδια έρχονται στην επιφάνεια για να αναπνεύσουν κάθε δύο ώρες ή νωρίτερα.
Εκατόδες είδη πουλιών ζουν στα κοραλλιογενή ρίφ. Περιλαμβάνουν sea eagles, γλάροι, auks, terns και skimmers. Τα πουλιά έχουν τα φωλιά τους στην ακτή ή στα νησιά που φτιάχνονται από ή περιβάλλουν τα κοραλλιογενή ρίφ. Τα θαλασσινά πουλιά τρώνε κυρίως ψάρια αρπάζοντάς τα από την επιφάνεια του νερού.
