Η έρημος Σονόραν παρεξηγεί αυτό που οι περισσότεροι άνθρωποι νομίζουν για μια έρημο. Πραγματικά ξεφουσκώνει από διάφορα φυτά, ζώα και πουλιά. Ενώ ο κάκτος συνδέεται συχνότερα με την έρημο, τα δέντρα ευδοκιμούν στο ξηρό κλίμα, ανάλογα με την υψόμετρο, την ετήσια βροχόπτωση και την επίδραση των ξηρών ποταμών και ποταμών. Αυτές οι γεωγραφικές και κλιματικές διαφορές συμβάλλουν στην ανάπτυξη ποικίλων ειδών δέντρων.
Αν και η βροχή είναι σπάνια στην έρημο Σονόραν, όταν πέφτει, έρχεται γρήγορα και σε μεγάλες ποσότητες. Η απορροή από τις καλοκαιρινές καταιγίδες τρέχει γρήγορα σε εποχιακούς κανάλους που ονομάζονται χείμαρροι. Τα δέντρα της ερήμου επωφελούνται από το μπόνους νερό κατά μήκος αυτών των χειμαρρών, και μεγαλώνουν σημαντικά ψηλότερα από τα ίδια είδη που αναπτύσσονται μόλις 100 πόδια από την άκρη ενός καναλιού.
Τα δέντρα που βρίσκονται κατά μήκος των ερημικών χειμαρρών περιλαμβάνουν την βελούδινη μεσκίτε (Prosopis velutina), μπλε παλό βερδε (Parkinsonia florida), ερημικό ιτί (Chilopsis linearis), δέντρο καπνού (Dalea spinosa) και ακακία γάτα (Acacia greggii).
Αν και τα επίπεδα νερού έχουν μειωθεί κατά τα τελευταία 100 χρόνια, η Αριζόνα είχε ποτέ πολλούς ποταμούς που έτρεχαν ολόκληρο το χρόνο. Με την αύξηση του πληθυσμού και την αντλία υδατοφόρων, αυτοί οι ποταμοί εξαφανίζονται σταδιακά. Μερικά νερά εξακολουθούν να ρέουν σε λίγους ποταμούς, αλλά συχνά εξαφανίζονται υπόγεια.
Τα είδη δέντρων κατά μήκος αυτών των ποταμών θεωρούνται ριπάρια είδη γιατί εξαρτώνται από το τακτικό νερό που παρέχουν οι ποταμοί. Το αριζονικό καρυδάκι (Populus fremontii), βελούδινη φραξί (Fraxinus velutina) και δικτυωτό χάκβερι είναι μεταξύ των αυτοχθόνων ειδών δέντρων που βρίσκονται κατά μήκος τμημάτων ριπάρια καταφυγίου. Επίσης βρέθηκαν κατά μήκος ποταμών το μη εγχώριο και εισβάλλον ταμάρισκ (είδη Tamarix), το οποίο απειλεί τους ριπάρια καταφυγές στενοχωρώντας τα εγχώρια δέντρα και πνίγοντας τα ποταμικά κανάλια.
Η έρημος Σονόραν χωρίζεται σε διαφορετικούς καταφυγίες που βασίζονται στην υψόμετρο και τα ετήσια ποσά βροχόπτωσης. Το Σονόραν desertscrub αναπτύσσεται σε δύο καταφυγίες, την υποδιαίρεση Αριζόνα Upland και την υποδιαίρεση Κάτω Κολομβιανής Ποταμίας.
Μακριά από χειμαρρους και ποταμούς, μερικά από τα ίδια είδη που βρίσκονται κατά μήκος χειμαρρών αναπτύσσονται, αλλά είναι μικρότερα σε μέγεθος. Πέρα από τη βελούδινη μεσκίτε και την ακακία γάτα, άλλα είδη δέντρων που βρίσκονται κατά μήλος χειμαρρών σε αυτόν τον καταφυγιό περιλαμβάνουν τον ερημικό σίδηρο (Olneya tesota), το παλό βερδε λόφων (Parkinsonia microphyllum) και την ακακία λευκόκαρπη (Acacia constricta). Περίεργα, το μπλε παλό βερδε βρίσκεται κατά μήκος δευτερευόντων απορροής.
Αυτή η υποδιαίρεση είναι το πιο ξηρό μέρος της ερήμου Σονόραν και έτσι έχει λιγότερα δέντρα από την ανώτερη διαίρεση. Κατά μήκος απορροών, όμως, βελούδινη μεσκίτε, μπλε παλό βερδε, σίδηρος και δέντρο καπνού μπορούν μερικές φορές να βρεθούν.
